大腸桿菌ER2566菌種RealTime PCR技術(shù)服務(wù):
一、熒光定量PCR化學(xué)原理介紹
實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)即是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,*后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。PCR擴(kuò)增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個報告熒光基團(tuán)和一個淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時,報告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。
二、大腸桿菌ER2566菌種主要實(shí)驗(yàn)步驟
1、設(shè)計并合成Realtime PCR引物。
2、引物溶解后使用Promega的TaqDNA聚合酶進(jìn)行含SG(SYBR® Green)的PCR反應(yīng)的優(yōu)化。
3、 樣品RNA抽提 實(shí)驗(yàn)對象為組織樣品,取適量(50-100mg)新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),勻漿后抽提RNA。
實(shí)驗(yàn)對象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1×106~1×107細(xì)胞,PBS清洗細(xì)胞,去PBS加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA
4、RNA質(zhì)量檢測
a. 大腸桿菌ER2566菌種紫外吸收測定法測定RNA在分光光度計260nm和280nm處的吸收值,以計算其濃度并評估RNA純度
b. 使用ambion公司的甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度及完整性。
5、使用逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega)進(jìn)行反應(yīng),將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。
6、 制備標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品:進(jìn)行相對定量,需要先將樣品的目的基因以及管家基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其產(chǎn)物進(jìn)行梯度稀釋用于做標(biāo)準(zhǔn)曲線。
7、標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品和待測樣品分別加入到含SG的RealTime PCR反應(yīng)液中(其中TaqBeadTM熱啟動聚合酶來自Promega公司),進(jìn)行RealTime PCR擴(kuò)增和檢測。
8、 大腸桿菌ER2566菌種檢測結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線分析:以對待測樣品的目的基因進(jìn)行定量。相對定量實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)一步用樣品的目的基因測得值除以管家基因測得值以校正誤差,所得結(jié)果代表某樣品的目的基因相對含量。
9、提供實(shí)驗(yàn)報告:包括詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方法及實(shí)時熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果的相關(guān)圖表。
三、大腸桿菌ER2566菌種樣本準(zhǔn)備
組織或細(xì)胞標(biāo)本