DE3 plysS 菌種RealTime PCR技術(shù)服務(wù):
一、熒光定量PCR化學(xué)原理介紹
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)即是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,*后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。
二、DE3 plysS 菌種主要實(shí)驗(yàn)步驟
1、設(shè)計(jì)并合成Realtime PCR引物。
2、引物溶解后使用Promega的TaqDNA聚合酶進(jìn)行含SG(SYBR® Green)的PCR反應(yīng)的優(yōu)化。
3、 樣品RNA抽提 實(shí)驗(yàn)對(duì)象為組織樣品,取適量(50-100mg)新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),勻漿后抽提RNA。
實(shí)驗(yàn)對(duì)象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1×106~1×107細(xì)胞,PBS清洗細(xì)胞,去PBS加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA
4、RNA質(zhì)量檢測(cè)
a. DE3 plysS 菌種紫外吸收測(cè)定法測(cè)定RNA在分光光度計(jì)260nm和280nm處的吸收值,以計(jì)算其濃度并評(píng)估RNA純度
b. 使用ambion公司的甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測(cè)RNA純度及完整性。
5、使用逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega)進(jìn)行反應(yīng),將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。
6、 制備標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品:進(jìn)行相對(duì)定量,需要先將樣品的目的基因以及管家基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其產(chǎn)物進(jìn)行梯度稀釋用于做標(biāo)準(zhǔn)曲線。
7、標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品和待測(cè)樣品分別加入到含SG的RealTime PCR反應(yīng)液中(其中TaqBeadTM熱啟動(dòng)聚合酶來(lái)自Promega公司),進(jìn)行RealTime PCR擴(kuò)增和檢測(cè)。
8、 DE3 plysS 菌種檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線分析:以對(duì)待測(cè)樣品的目的基因進(jìn)行定量。相對(duì)定量實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)一步用樣品的目的基因測(cè)得值除以管家基因測(cè)得值以校正誤差,所得結(jié)果代表某樣品的目的基因相對(duì)含量。
9、提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告:包括詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方法及實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果的相關(guān)圖表。
三、DE3 plysS 菌種樣本準(zhǔn)備
組織或細(xì)胞標(biāo)本